Desde la antigüedad la limpieza del colon se realizó vía enemas o métodos laxantes de diverso tipo, los cuales realizaban una limpieza intestinal insuficiente cuando no exenta de inconvenientes.
Los primeros datos históricos se encuentran en Egipto, donde los médicos-sacerdotes practicaban enemas o lavativas con fines terapéuticos, el papiro Ebers del antiguo Egipto, fechado en el año 3000 a.C. ya deja entrever la importancia de la limpieza de colon por vía rectal.
Igualmente, numerosas civilizaciones (Egipto, Mesopotámia, Grecia, China, India, Indios de América, Esenios, etc.) nos aportan las pruebas de que, en todos los tiempos, la limpieza del intestino grueso se ha preconizado como una simple medida de higiene, como acción terapéutica o incluso como procedimiento de purificación interior.
Hipócrates (460-377 a.C.) describió la manera de hacer lavados de colon e indicó qué tipos de plantas había que añadir en función del tipo de patología.
En la Edad Media, los médicos practicaban lavados con soluciones complejas cuyas fórmulas están recogidas en el "antidotarius magnus".
Ambrosio Paré (s. XVI) es el primero que describe minuciosamente la irrigación del colon y la distingue del simple lavado.
En el Diccionario Médico Ilustrado Larousse de 1906 encontramos diferentes informaciones concernientes a la práctica de los lavados y de la hidroterapia de colon.
Son los romanos quienes adoptaron esta tradición, que se mantuvo hasta nuestros días.
La hidroterapia de colon se desarrolló a principios del siglo XX fundamentado en la importancia de la nutrición y los hábitos alimenticios en el desarrollo de ciertas enfermedades. En la actualidad y debido al avance de la tecnología médica la terapia se puede realizar de forma profunda, indolora y sencilla. En los Estados Unidos de Norteamérica surge la moderna hidrocolonterapia, que rápidamente se extiende a otros continentes, en especial Europa (Alemania, Inglaterra y España). Gracias a la extensión y eficacia del tratamiento el mismo llega a México.
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